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我国有了微生物组数据平台

作者:          审稿:              来源:健康报网          发布时间:2018-11-05 14:45:37          浏览次数:          
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      中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队最近搭建完成中国微生物组数据平台。该平台名为“gcMeta”,将为国内外用户提供从数据存储、分析到发布的服务。平台目前已整合国内外多个重要项目的数据。

  据悉,微生物组大数据的收集、存储、功能挖掘和开发利用一直是制约微生物组发展的核心问题。2017年,中科院启动了中国微生物组计划,其中包括建立微生物组大数据计算、存储和共享平台,开发微生物组大数据挖掘的新方法,以实现我国微生物组数据资源的系统管理和高效利用。

  据了解,该平台是集微生物基因组、元基因组和转录组管理、数据在线分析、可视化及数据发布的一站式系统。目前,已经整合国际相关平台和重要项目超过12万个样本数据,以及来自我国科学家的2000余个样本数据。平台将为用户提供多级的数据管理和权限控制体系,为所有公开数据提供持久标识符,用于在学术期刊的公开发表及后续数据引用及分析。